水体生态平衡很主要的一个内容是研究生涯情形中的生态因子。生态因子是指对活的有机体爆发种种影响的情形因素，，而种种生态因子中最主要的是找出限制因子。若是生物对某个因子的耐性限度有限，，这个因子在情形中又容易转变，，这个因子就可能成为限制因子。例如，，氧气，，关于陆生生物来说，，因其数目富厚又很稳固，，很少成为限制因子。但关于水生生物来说，，氧气，，因其数目少又经常转变，，则很容易成为限制因子。

水中的消融氧含量则是水生生物的生涯情形中的最主要的限制因子，，决议着水体的生态平衡。所谓“水体受污染”就是大宗的有机污染物（即营养物、、即肥料）进入水体后消耗水中的消融氧凌驾了水体的自净能力而称之，，因而破损了水体的生态平衡；；；指匆驯黄扑鸬纳胶，，就要凭证生态失调的标记接纳响应的步伐，，研究水体生态平衡修复一定不可遗忘这一最主要的限制因子。这就是水体受污染后生涯情形的特殊性。不可消除有机污染物和恢复水中的消融氧，，水体生态平衡就不可能修复：雎哉庖惶厥庑，，则对水体中生态系统的修复效果就不大。

研究生物群落演替的爆发。

研究水体的生态平衡修复的另一个主要的内容是研究生物群落的演替。生物群落这一术语是莫比乌斯（Mobius）于1877年首先提出，，生物群落是一种动态组合，，随着情形条件的改变及其自身的开展，，群落中会一直泛起一些新的种类，，这种新的种类取代了另一些消逝的种类，，并使群落从一种类型演酿成另一种类型。
水生演替系列中植物群落的演替概略为：自由漂浮植物阶段——沉水植物群落阶段——浮叶根生植物群落阶段——挺水植物群落阶段——湿生草本植物阶段——木本植物阶段。这些演替的每一个阶段都需几十年、、几百年，，代表着每一个时代的流逝，，不可能逆向开展，，（即不可能试图用莳植沉水植物让水生生态演替逆行恢复为自由漂浮植物阶段）。

岛屿生物平衡模子

1963年Mac Arthur和Wilson首次提出岛屿生物群集模子（Colonization  Model）的理论。他们以为，，岛屿各有差别的、、自力的地理情形，，其动植物区系也有差别。当物种由外部迁入，，又称群集（Colonization）的初期种种物种间没有影响，，群集速率大多受迁入物种的扩散能力和迁出纪律的影响。只有当迁入物种的群集速率与消逝速率相同时，，种数就抵达了平衡点，，此时群落内就会爆发捕食、、被捕食、、竞争等种间的相互作用。这种作用决议岛屿的生物组成，，就显出群落的统一性。岛屿生物群落的这一特征就是Mac Arthur  Wilson岛屿生物平衡模子（Equilibrium  Model of Island Biography）的要点。

学者们以为相同生境中若有伶仃的、、有机体难逾越的小生境，，也可以以为这类小生境是“岛”。以是种种水体中的石头、、沉水的木块，，甚至某些人工基质等也可以从生态学角度以为是一个“岛”。当某一自然基质某人工基质在水体中最先泛起时，，一些微型生物（主要指细菌、、藻类、、原生动物，，有时也包括小型的后生动物如轮虫等）即会在这种基质上举行群集。它所群集的微生物代表了食物链上的几个营养级，，可以模拟自然生物群落的演替。

由此可见使用自然基质某人工基质（即填料）放入水体中成为生态学中的“岛”，，一些微型生物即会群集，，群落内就会爆发捕食、、被捕食、、竞争等种间的相互作用，，爆发食物链，，恢复水体生态平衡。水体生态平衡修复理论最主要的焦点内容就是研究怎样消除有机污染物，，恢复水体中的消融氧含量和岛屿生物平衡模子连系起来，，综合应用。